電導檢測是離子色譜檢測方式中最常用的一種。由於電導池中的等效電容的影響，施加到電導池上的電壓和電流之間的關係是非線性的，這給丈量電導值帶來很大困難。另外，活動相中本底電導值很高，從較大的背景值中正確丈量待測組分的信號，也是電導檢測中的重要題目。目前采用較多的方法有：雙極脈衝化學抑製型電導檢測、五電極檢測和模擬信號交流鎖相放大等技術。
一、雙極脈衝電導檢測
采用可變頻率雙極脈衝化學抑製型電導檢測方式，以美國Dionex公司為代表。該檢測方式有效地抑製了電導池等效電容和活動相本底電導的影響，測定靈敏度高，線性範圍寬，穩定性好。
它采用8085芯片作為中心處理器(CPU)，通過處理機輸進輸出部件(PIO)對其他單元進行控製，由CPU時鍾分頻觸發後產生雙極脈衝，經整形後送至電導池；電導池返回的信號在第二個脈衝後被采樣，並轉換為一個直流信號，此信號與溫度測定信號交替送進電壓頻率變換器，數字信號送至CPU。在進行補償時，CPU將這個信號處理後，通過D／A(補償)轉換器，送回放大電路，對原信號進行補償，直至比較輸出呈”OK”狀態。信號的輸出也是通過V／F變頻電路送至CPU，CPU對其處理後通過D／A(輸出)變頻電路，經驅動器輸出至數據處理器。
二、五電極電導檢測
采用五電極電導丈量技術，能有效地消除雙電層電容和電解效應的影響。其結構特點是在流路上設置4個電極，在電路設計中維持兩丈量電極間電壓恒定不受負載電阻、電極間電阻和雙電層電容變化的影響。因此，兩丈量電極間的電流變化，可從負載電阻兩端取出信號進行放大和顯示。第五電極為屏蔽電極，它有助於進步丈量的穩定性。五電極式電導檢測器有效地消除了極化和電解效應的影響，在高背景電導下仍能獲得極低的噪聲水平，適合作非化學抑製型電導檢測器。
此外，離子色譜還可以采用紫外、可見光、熒光、安培等高效液相色譜常用的檢測器，其原理與常規的高效液相色譜檢測相似。
